ערכת DNA של כתמי דם מגנטיים

A-1 ריכוז נמוך של תאים או וירוסים במדגם ההתחלתי-העשיר את ריכוז התאים או הנגיפים.

A-2 תמוגה לא מספקת של הדגימות-הדגימות לא התערבבו היטב עם מאגר התמוגה. מומלץ לערבב היטב על ידי פולס-מערבולת במשך 1-2 פעמים. - לא מספיק תמוגה של תאים הנגרמת כתוצאה מירידה בפעילות של פרוטאינאז ק. - תמוגה לא מספקת של תאים או פירוק חלבון עקב זמן רחצה חם מספיק. מוצע לחתוך את הרקמה לחתיכות קטנות ולהאריך את זמן הרחצה כדי להסיר את כל השאריות בליזאט.

A-3 ספיחת DNA לא מספקת. -לא נוספו אתנול או אחוז נמוך במקום 100% אתנול לפני העברת הליזאט לעמודת הספין.

A-4 ערך ה- pH של מאגר התנאי נמוך מדי. -התאם את ה- pH בין 8.0-8.3.

שארית אתנול בחמאה.

- יש חיץ כביסה שיורי PW ב eluent. אתנול ניתן להסיר על ידי צנטריפוגה של עמוד הספין למשך 3-5 דקות, ולאחר מכן הצבה בטמפרטורת החדר או חממה 50 for למשך 1-2 דקות.

A-1 המדגם אינו טרי. - חלץ DNA מדגם חיובי כבקרה כדי לקבוע אם ה- DNA בדגימה התדרדר.

A-2 טיפול מוקדם לא תקין. - נגרמת כתוצאה משחיקה חנקנית נוזלית מוגזמת, החזרת הלחות או כמות גדולה מדי של הדגימה.

הטיפולים המקדימים צריכים להשתנות לדגימות שונות. עבור דגימות צמחים, הקפד לטחון היטב בחנקן נוזלי. עבור דגימות של בעלי חיים, הומוגנט או לטחון היטב בחנקן נוזלי. לדגימות עם קירות תא שקשה לשבור אותן, כגון חיידקי G+ ושמרים, מומלץ להשתמש בליזוזים, lyticase או שיטות מכניות לשבירת קירות התא.

4992201/4992202 ערכת ה- DNA הגנומית הצמחית מאמצת שיטה מבוססת עמוד הדורשת כלורופורם לצורך המיצוי. הוא מתאים במיוחד לדגימות צמחים שונות, כמו גם לאבקה יבשה של צמחים. ערכת הצמחים Hi-DNAsecure מבוססת גם היא על עמודות, אך ללא צורך במיצוי פנול/כלורופורם, מה שהופך אותה לבטוחה ולא רעילה. הוא מתאים לצמחים בעלי פוליסכרידים גבוהים ותכולת פוליפנול. 4992709/4992710 DNAquick Plant System מאמצת שיטה מבוססת נוזלים. אין צורך גם במיצוי פנול/כלורופורם. הליך הטיהור פשוט ומהיר ללא הגבלה של כמויות ההתחלה של המדגם, כך שמשתמשים יכולים להתאים את הכמות בגמישות בהתאם לדרישות הניסוי. ניתן להשיג גודל גדול של שברי gDNA עם תשואה גבוהה.

ה- DNA הגנומי הופק מנפחים שונים של דגימות דם שלם על ידי ערכת DNA TIANamp Blood. התוצאות הן כדלקמן. התוצאות מופיעות כהפניה בלבד, תוצאות החילוץ בפועל תלויות בתנאי הדגימות.

ניתן לבצע את מיצוי ה- DNA של קריש דם באמצעות הריאגנטים המסופקים בשתי ערכות אלה על ידי שינוי פשוט של הפרוטוקול להוראה הספציפית להפקת ה- DNA קריש דם. ניתן להוציא את העותק הרך של פרוטוקול מיצוי ה- DNA קריש דם על פי בקשה.

להשעות את המדגם הטרי עם 1 מיליליטר PBS, תמיסת מלח רגילה או TE. לגמרי homogenize המדגם על ידי homogenizer ולאסוף את המשקע לתחתית הצינור על ידי צנטריפוגה. להשליך את תגובת שיקוע, ולהשעין מחדש את המשקע עם 200 μl מאגר GA. ניתן לבצע את טיהור ה- DNA הבא על פי ההוראות.

לטיהור gDNA בדגימות פלזמה, סרום ונוזלי גוף, מומלץ לערוך ערכת DNA TIANamp Micro. לטיהור gDNA הנגיף מדגימות סרום/פלזמה, מומלץ ערכת DNA/RNA של TIANamp Virus. לטיהור gDNA חיידקי מדגימות סרום ופלזמה, מומלץ ערכת DNA של חיידקי TIANamp (יש לכלול ליזוזים לחיידקים חיוביים). עבור דגימות רוק, מומלץ ערכת DNA Hi-Swab וערכת TIANamp Bacteria DNA.

ערכת צמחים DNAsecure או מערכת צמחים DNAquick מומלצים להפקת גנום פטרייתי. לצורך מיצוי גנום שמרים, מומלץ לערוך DNA TIMAN שמרים (Lyticase צריך להיות מוכן בעצמו).